مطالعه ساختار ژنتیکی برخی از ژن های مرتبط با صفات تولیدی در لاین طیور گوشتی تجاری
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده کشاورزی
- نویسنده مجتبی درزی نیارمی
- استاد راهنما علی اکبر مسعودی رسول واعظ ترشیزی
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1390
چکیده
در این مطالعه به منظور بررسی ساختار و تفاوت های ژنتیکی برخی از ژن های مرتبط با سوخت وساز انرژی و یا رشد پرندگان در طیور گوشتی، نمونه های خون از 4 خط لاین گوشتی تجاری آرین بدست آمد. در ادامه dna کل نمونه ها با استفاده از روش شستشوی نمکی استخراج شدند. سپس با استفاده از توالی های موجود در سایت بین المللی اطلاعات ژنوم موجودات، آغازگرهای اختصاصی جهت تکثیر کامل ژن های ucp و nd5 و نیز جهت تکثیر نقاط چند شکل ژن های ghsr، atgl، tgfb2، tgfb3 و visfatin با استفاده از نرم افزار الیگو طراحی شده و طی شرایط استاندارد pcr، قطعات ژنی تکثیر شدند. سپس توالی یابی کامل دو ژن ucp و nd5 با بکار گیری روش خاتمه زنجیره انتهایی و استفاده از bigdye در یک ترکیب ژنی از 50 پرنده انجام شد. در ادامه تفاوت های تک نوکلئوتیدی مشخص شده در دو ژن فوق به همراه ژن های ذکرشده دیگر با استفاده از روشهای ساده pcr-sscp و pcr-rflp در250 نمونه بررسی و ژنوتیپ های پرندگان مشخص شدند. ارتباط ژنوتیپ های هر جایگاه ژنی با اطلاعات فنوتیپی صفات رشد و لاشه و اثر جایگزینی آللی با اعمال مدل مناسب با استفاده از نرم افزار spss بررسی شد. نتایج مرحله اول نشان داد که ژن nd5 در جمعیت فوق هیچگونه تفاوت نوکلئوتیدی نداشت ولی ژن ucp در این لاین تجاری 5 تفاوت نوکلئوتیدی در نقاط بالادست، اینترونی، اگزونی و پایین دست ژن آشکار کرد. آنالیز اطلاعات مشخص کرد که بین چند شکلی a(-40)>t ژن ucp با ضریب تیدیل غذایی، مصرف غذای باقیمانده و میانگین افزایش وزن روزانه ارتباط معنی داری (p<0.00) وجود دارد. همچنین جایگاه چند شکل c3286>t ژن ghsr با صفات مصرف غذای روزانه (p<0.05) و با میزان چربی بطنی، درصد چربی بطنی و میانگین افزایش وزن روزانه ارتباط معنی داری (p<0.00) نشان داد. چند شکلی t(-640)>c ژن tgfb2 با ضریب تبدیل غذایی، مصرف غذای باقیمانده، مصرف غذای روزانه و وزن ساق پا درسطح 05/0 و با وزن زنده، وزن لاشه و درصد لاشه ارتباط معنی داری (p<0.00) داشت. وقوع تغییرات فوق در نواحی اگزونی با تاثیر بر دومین پروتئینی و یا در نواحی پروموترژنی با تاثیر بر فاکتورهای نسخه برداری مانند myod در ژن ucp و یا ap-1 در ژن tgfb2 و همچنین تعامل سیستمی با ژن های دخیل در فرآیند های مختلف متابولیسم انرژی و یا چربی ممکن است علت اینگونه ارتباطات معنی دار باشد. دیگر جایگاه های بررسی شده در این جمعیت یک شکل بوده، بنابراین هیچگونه ارتباطی با صفات مورد مطالعه قابل بررسی نمی باشد.
منابع مشابه
بررسی ساختار ژن TLR4 در دو سویه از طیور تجاری لاین آرین و بومی آذربایجان غربی
در این مطالعه، ساختار ژن TLR4 به‌عنوان گیرندۀ اصلی در شناسایی لیپوپلیساکارید باکتریهای گرم منفی در دو سویه از طیور تجاری لاین آرین و بومی آذربایجان غربی بررسی و بیان آن در برخی از اندامهای اصلی مطالعه شد. از ۱۲۰ قطعه پرنده خونگیری و DNA کل آنها استخراج شد. با طراحی چهار جفت آغازگر اختصاصی، کل ژن TLR4 در چهار قطعه از پرندگان هر سویه توالییابی شد. تأثیرات تغییرات اسیدآمینهای بر عملکرد پروت...
متن کاملتجزیه ساختار ژنتیکی برخی صفات مهم زراعی در برنج با استفاده از تجزیه لاین × تستر
To determine the genetic structure, general and specific combining ability of some important agronomic characters, eight rice cultivars including 5 lines and 3 testers were crossed in Rice Research Institute of Iran (RRII), at Rasht, in 2000. Parental lines and F1 were planted in a Randomized Complete Block Design with three replications in the year 2001. Eleven important agronomic traits inclu...
متن کاملشناسایی ژن های عمده صفات وزن یک‌روزگی و شش‌هفتگی در یک لاین تجاری گوشتی با استفاده از روش تفرق بیزی
At the present study in order to detect major genes in a commercial broiler line Bayesian method as the most powerful statistical method in detection of major genes was used. After preliminary data editing, data of body weight (BW) at birth and six weeks of age of 14 and 35 generations respectively were analyzed using iBay software. The results verified segregation of major gene for two economi...
متن کاملتجزیه ساختار ژنتیکی برخی صفات مهم زراعی در برنج با استفاده از تجزیه لاین × تستر
To determine the genetic structure, general and specific combining ability of some important agronomic characters, eight rice cultivars including 5 lines and 3 testers were crossed in Rice Research Institute of Iran (RRII), at Rasht, in 2000. Parental lines and F1 were planted in a Randomized Complete Block Design with three replications in the year 2001. Eleven important agronomic traits inclu...
متن کاملارتباط چند شکلی ناحیه ای از ژن کاندیدای STAT5B با صفات مرتبط با رشد و آسیت در یک لاین تجاری
Ascites syndrome, also called pulmonary hypertension syndrome is a major concern of the poultry industry for decades. There have been a numerous reports regarding the underlying genetic variability of different breeds/strains in resistance against ascites. This scenario indicates gaining deep insight into the genomes of chicken pure lines, in order to find the favorable alleles within candidate...
متن کاملبررسی ساختار ژن tlr4 در دو سویه از طیور تجاری لاین آرین و بومی آذربایجان غربی
در این مطالعه، ساختار ژن tlr4 به عنوان گیرندۀ اصلی در شناسایی لیپوپلیساکارید باکتریهای گرم منفی در دو سویه از طیور تجاری لاین آرین و بومی آذربایجان غربی بررسی و بیان آن در برخی از اندامهای اصلی مطالعه شد. از ۱۲۰ قطعه پرنده خونگیری و dna کل آنها استخراج شد. با طراحی چهار جفت آغازگر اختصاصی، کل ژن tlr4 در چهار قطعه از پرندگان هر سویه توالییابی شد. تأثیرات تغییرات اسیدآمینهای بر عملکرد پروتئ...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده کشاورزی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023